جهاد اسلامی علیرغم دستاوردهایی که داشته است در راستای تحقق هدف نهایی خود با چالش هایی روبرو است؛ از جمله: مشارکت فعال در روندهای سیاسی و هماهنگی با سایر گروه های مقاومت در جهت پیشبرد طرحی برای آزادسازی فلسطین.

تصمیم وزیر کار لبنان برای مقابله با کارگران خارجی تظاهرات فلسطینی‌ها را در پی داشته است. پناهندگان فلسطینی می‌ترسند این اقدام ضربه‌های بیشتری به فرصت‌های شغلی آنها وارد کند. این مشکلات ضرورت اجرای حق بازگشت آوارگان را نمایان می سازد.